La maggior parte delle persone che assume la PrEP non soffre di effetti indesiderati
Ciononostante, come tutti gli altri medicinali, anche la PrEP potrebbe causare effetti indesiderati. Circa una persona su dieci, durante il primo mese di utilizzo, ha accusato una leggera nausea, diarrea, gonfiore o mal di testa. Solitamente spariscono in fretta in pochi giorni o un paio di settimane. La PrEP potrebbe affaticare la funzionalità renale: quindi è importante controllarlal periodicamente. Anche perché si è seguitə da un centro apposta.